Toyoko presenta Python para Bioinformática

PRIMERA EDICIÓN en español y OPEN SOURCE

LIBRO
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Una sólida introducción a la programación con Python, muy accesible para los lectores sin experiencia previa en programación. Python for Bioinformatics está pensado para biólogos, bioinformáticos y otros profesionales de las ciencias de la vida.

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Primera edición en español de Python for Bioinformatics. Esta traducción es de la segunda edición en inglés (la más actual). Hubo muchos cambios desde la primera edición que fue escrita en 2009, como el uso de Python 3. En este momento el estándar es 3.8 y es la versión usada en el libro. Con respecto a la versión original se agregó un capítulo sobre gráficos, se incluyeron las bases de datos NoSQL y se explica un framework web en su totalidad.

  • Python desde cero: Conceptos básicos de programación, instalando Python, modo interactivo, editores, tipos de datos (cadenas, Unicode, listas, tuplas, diccionarios, conjuntos), control de flujo (If-Else, For, While), funciones, generadores, módulos, uso de archivos incluidos CVS, JSON y archivos de operaciones, manejo de errores y programación orientada a objetos.
  • Biopython: Los módulos mas importante explicados con ejemplos de uso.
  • Una sección con tópicos avanzados tales como: desarrollo web (CGI y Bottle), XML, base de datos (MySQL, SQLite y MongoDB), REGEX y gráficos (Bokeh).
  • Recetas de Python con código comentado.

El libro cuenta con cuatro secciones principales:

Contenidos del libro

Sobre este libro

Sobre la publicación

En Github están los archivos que conforman la versión en español del libro "Python para Bioinformática".

Estos archivos son para editar el libro, ya sea para hacer una copia propia o para proponer modificaciones: enviar correcciones, sugerir nuevos temas, agregar nuevos capítulos, traducirlo a otros idiomas (portugués por ejemplo), etc. Las contribuciones son bienvenidas.

Si están interesados en el libro listo para leer, lo pueden descargar gratuitamente en Leanpub (también está la opción de pagar en el caso que se sientan generosos).

El código

Todos los ejemplos de código que se encuentran en el libro están disponibles en Github o como una notebook de Jupyter que se puede ejecutar en línea.

Ir a la página del libro en Github y hacer click en el botón verde "Clonar o descargar". El proyecto incluye todos los archivos .py listos para ser ejecutados localmente y archivos complementarios utilizados en el libro.




Jupyter logo Github logo

Jupyter Notebook

Código en Github

El código puede correrse online en una notebook en el sitio de Mybinder.org. Las Jupyter notebooks (en formato .ipynb) también pueden ser bajadas del directorio de Notebooks y correrla localmente si poseen una Jupyter instalada.




Python para Bioinformática

Primera edición en español y open source.

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